马克思主义经济学作为中国的主流经济学经历了从传统主流向当代主流的嬗变，主流化嬗变背后的历史逻辑是中国发展模式的变迁。传统主流的局限主要是由释读化研究倾向所带来的，表现为违背问题意识导向、混淆理论研究和政策研究、无法形成逻辑一致的分析框架。当代主流的创新主要体现在研究方法的科学性、理论体系的开放性、对现实问题的指导性和实践性，但它仍面临着“认同之困、体用之困、转换之困”等诸多困境。为继续加强马克思主义经济学的主流地位，必须处理好：（1）垄断与竞争的关系，形成公平的学术研究环境；（2）思想与工具的关系，形成正常的学术价值取向；（3）规范与嵌合的关系，形成科学的学术发展机制。