中医学是中国自然学第一学，是中国第一大科学发现与发明，中医5000年创造了三大奇迹，20世纪三大实践提出三大科学难题，正在推动医学和科学的新革命。中医的这些成就完全在西方医学的视野之外，其内在根源是中医没有西医那样的还原论思想，而是遵循系统论思维，它是中国传统系统论思维孕育的产物，是以人为本研究健康与疾病的复杂性的思想结晶。中医思维方式的系统论性质由钱学森首先揭示，他强调人体科学一定要有系统观，而这正是中医的观点，发展系统论思维是医学的正道，西医也要走到中医的道路上来。1980年开始的中医系统论研究，把中医系统论思维从朴素水平提高到现代水准，提出了六条基本原理，即元整体、非加和、有机性、功能性、有序性、自主性。中医系统论是系统科学的医学分支，是中医现代研究的新成果，将发展成为人类医学的最新思维方式。