中国基本经济制度的完善，必然包含以利益分配为核心的劳动关系调节制度的完善。伴随改革开放而产生的民营企业劳动关系十分复杂，并随着民营经济的发展而不断扩张和内生出大量冲突。处理好民营企业的劳动关系，对经济发展和社会和谐意义重大。本文通过对浙江民营企业调查问卷分析，揭示转型期民营企业劳动关系的状况以及工资、保障、培训、工会等因素对劳动关系的影响程度。在此基础上，本文提出以下建议：要从总报酬的视野全面提高资本对劳动的报酬，政府应尽快完善用工制度环境，形成稳定的劳动关系，引导企业成为人力资本的投资主体，形成人力资本良性累积机制；加快企业工会职能的归位，推动集体谈判制度广泛实行，形成力量均衡连续博弈的利益分配机制。