中国东北海关是日本进入中国海关体系并扩展其在海关势力的基础，北京政府在东北海关开征二五附加税，触动了日本的既得利益，日本遂挑起了对中国东北海关乃至中国政府的对抗。起初东北海关监督面对日本的压迫，采取了“告而不征”的手法，但很快受天津海关成功对日商征税的鼓舞决定执行征收。附加税开征逐渐明朗，币原喜重郎与奉天总领事吉田茂讨论后，要求日商只能在租借地和附属地外向海关或税捐局缴纳附税。出于对外务省政策的不满，吉田茂还设想对奉系集团在东北开征附加税表示谅解，以此为条件扩大日本在满蒙的权益，但其设想被外务省否决，与奉天省长莫德惠的交涉也无疾而终。尽管东北各关坚决开征附加税，但各关还是对日本做出了较大的妥协，这使得中日间矛盾逐渐激化，北京政府时期东北二五附加税问题终成悬案。